MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis RC-J/966

Total Repeats: 20300

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021898	ATG	2	6	1336	1341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527327368
2	NC_021898	GTG	2	6	1342	1347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	527327368
3	NC_021898	TCC	2	6	1351	1356	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527327368
4	NC_021898	AGC	2	6	1365	1370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527327368
5	NC_021898	T	6	6	1384	1389	0 %	100 %	0 %	0 %	527327368
6	NC_021898	AGC	2	6	1392	1397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527327368
7	NC_021898	AAG	2	6	1403	1408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527327368
8	NC_021898	TAC	2	6	1441	1446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527327368
9	NC_021898	GCT	2	6	1451	1456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527327368
10	NC_021898	AGTA	2	8	1489	1496	50 %	25 %	25 %	0 %	527327368
11	NC_021898	AAC	2	6	1549	1554	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527327368
12	NC_021898	AGA	2	6	1561	1566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527327368
13	NC_021898	AGA	2	6	1817	1822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527327369
14	NC_021898	ATC	2	6	1824	1829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527327369
15	NC_021898	TGC	2	6	1844	1849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527327369
16	NC_021898	ATGA	2	8	1893	1900	50 %	25 %	25 %	0 %	527327369
17	NC_021898	GATA	2	8	1931	1938	50 %	25 %	25 %	0 %	527327369
18	NC_021898	CAT	2	6	1968	1973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527327369
19	NC_021898	AGA	2	6	1997	2002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527327369
20	NC_021898	AAG	2	6	2026	2031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527327369
21	NC_021898	GGA	2	6	2061	2066	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527327369
22	NC_021898	AG	3	6	2153	2158	50 %	0 %	50 %	0 %	527327370
23	NC_021898	ATC	2	6	2190	2195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527327370
24	NC_021898	TC	3	6	2234	2239	0 %	50 %	0 %	50 %	527327370
25	NC_021898	ATA	2	6	2340	2345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527327370
26	NC_021898	AAC	2	6	2365	2370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527327370
27	NC_021898	GGT	2	6	2419	2424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	527327370
28	NC_021898	AAT	2	6	2525	2530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527327370
29	NC_021898	TTC	2	6	2560	2565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527327370
30	NC_021898	GCA	2	6	2579	2584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527327370
31	NC_021898	GGA	2	6	2627	2632	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527327370
32	NC_021898	CAG	2	6	2646	2651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527327370
33	NC_021898	GTT	2	6	2663	2668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527327370
34	NC_021898	GGT	2	6	2755	2760	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	527327370
35	NC_021898	GA	3	6	2821	2826	50 %	0 %	50 %	0 %	527327370
36	NC_021898	T	6	6	2828	2833	0 %	100 %	0 %	0 %	527327370
37	NC_021898	AAG	2	6	2913	2918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527327370
38	NC_021898	ATT	2	6	2975	2980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527327370
39	NC_021898	TTG	2	6	3027	3032	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527327370
40	NC_021898	CATG	2	8	3109	3116	25 %	25 %	25 %	25 %	527327370
41	NC_021898	AAG	2	6	3138	3143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527327370
42	NC_021898	AAG	2	6	3153	3158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527327370
43	NC_021898	CAG	2	6	3195	3200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527327370
44	NC_021898	GCT	2	6	3266	3271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527327370
45	NC_021898	TGTGA	2	10	3281	3290	20 %	40 %	40 %	0 %	527327370
46	NC_021898	TTCC	2	8	3414	3421	0 %	50 %	0 %	50 %	527327370
47	NC_021898	AAG	2	6	3432	3437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527327370
48	NC_021898	CAG	2	6	3482	3487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527327370
49	NC_021898	GGA	2	6	3569	3574	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527327370
50	NC_021898	AAT	2	6	3579	3584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527327370
51	NC_021898	TTGAA	2	10	3637	3646	40 %	40 %	20 %	0 %	527327371
52	NC_021898	ATT	2	6	3659	3664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527327371
53	NC_021898	TGA	2	6	3689	3694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527327371
54	NC_021898	TTTA	2	8	3812	3819	25 %	75 %	0 %	0 %	527327371
55	NC_021898	GTA	2	6	3921	3926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527327371
56	NC_021898	GAGAA	2	10	3931	3940	60 %	0 %	40 %	0 %	527327371
57	NC_021898	AGA	2	6	3968	3973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527327371
58	NC_021898	ATCC	2	8	4112	4119	25 %	25 %	0 %	50 %	527327371
59	NC_021898	GAA	2	6	4152	4157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527327371
60	NC_021898	CGT	2	6	4284	4289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527327371
61	NC_021898	A	7	7	4328	4334	100 %	0 %	0 %	0 %	527327371
62	NC_021898	GTT	2	6	4335	4340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527327371
63	NC_021898	GAAAA	2	10	4368	4377	80 %	0 %	20 %	0 %	527327371
64	NC_021898	A	7	7	4374	4380	100 %	0 %	0 %	0 %	527327371
65	NC_021898	TGA	2	6	4472	4477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527327371
66	NC_021898	AT	3	6	4514	4519	50 %	50 %	0 %	0 %	527327371
67	NC_021898	TTACA	2	10	4523	4532	40 %	40 %	0 %	20 %	527327371
68	NC_021898	TTG	2	6	4567	4572	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527327371
69	NC_021898	TTC	2	6	4708	4713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527327371
70	NC_021898	TCT	2	6	4800	4805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527327371
71	NC_021898	AGA	2	6	4820	4825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527327371
72	NC_021898	GTT	2	6	4847	4852	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527327371
73	NC_021898	GACG	2	8	4859	4866	25 %	0 %	50 %	25 %	527327371
74	NC_021898	GGT	2	6	4895	4900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	527327371
75	NC_021898	AAAGCT	2	12	4941	4952	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	527327371
76	NC_021898	TTGG	2	8	4962	4969	0 %	50 %	50 %	0 %	527327371
77	NC_021898	CTC	2	6	4999	5004	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527327371
78	NC_021898	AGC	2	6	5030	5035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527327371
79	NC_021898	ATT	2	6	5149	5154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527327372
80	NC_021898	TCT	2	6	5167	5172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527327372
81	NC_021898	GCT	2	6	5213	5218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527327372
82	NC_021898	GTCTT	2	10	5219	5228	0 %	60 %	20 %	20 %	527327372
83	NC_021898	GAT	2	6	5248	5253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527327372
84	NC_021898	TC	3	6	5264	5269	0 %	50 %	0 %	50 %	527327372
85	NC_021898	GA	3	6	5275	5280	50 %	0 %	50 %	0 %	527327372
86	NC_021898	ACG	2	6	5286	5291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527327372
87	NC_021898	GAA	2	6	5310	5315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527327372
88	NC_021898	TGGA	2	8	5323	5330	25 %	25 %	50 %	0 %	527327372
89	NC_021898	AT	3	6	5379	5384	50 %	50 %	0 %	0 %	527327372
90	NC_021898	AGA	3	9	5387	5395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527327372
91	NC_021898	GCT	2	6	5396	5401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527327372
92	NC_021898	AGA	2	6	5405	5410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527327372
93	NC_021898	TGG	2	6	5441	5446	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	527327372
94	NC_021898	AGA	3	9	5459	5467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527327372
95	NC_021898	GGA	2	6	5468	5473	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527327372
96	NC_021898	TG	3	6	5532	5537	0 %	50 %	50 %	0 %	527327372
97	NC_021898	TA	3	6	5603	5608	50 %	50 %	0 %	0 %	527327372
98	NC_021898	T	6	6	5610	5615	0 %	100 %	0 %	0 %	527327372
99	NC_021898	TCA	2	6	5653	5658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527327372
100	NC_021898	GGA	2	6	5690	5695	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527327372
101	NC_021898	CTTT	2	8	5700	5707	0 %	75 %	0 %	25 %	527327372
102	NC_021898	CTT	2	6	5750	5755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527327372
103	NC_021898	CTG	2	6	5756	5761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527327372
104	NC_021898	CAG	2	6	5911	5916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527327372
105	NC_021898	AG	3	6	5940	5945	50 %	0 %	50 %	0 %	527327372
106	NC_021898	GGGA	2	8	6215	6222	25 %	0 %	75 %	0 %	527327372
107	NC_021898	AGG	2	6	6440	6445	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527327373
108	NC_021898	GAA	2	6	6484	6489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527327373
109	NC_021898	GGTG	2	8	6518	6525	0 %	25 %	75 %	0 %	527327373
110	NC_021898	AAAT	2	8	6584	6591	75 %	25 %	0 %	0 %	527327373
111	NC_021898	GCA	2	6	6748	6753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527327373
112	NC_021898	AAG	2	6	6789	6794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527327373
113	NC_021898	TGC	2	6	6822	6827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527327373
114	NC_021898	ATTT	2	8	7096	7103	25 %	75 %	0 %	0 %	527327374
115	NC_021898	TTA	2	6	7154	7159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527327374
116	NC_021898	TTTG	2	8	7188	7195	0 %	75 %	25 %	0 %	527327374
117	NC_021898	GAA	2	6	7203	7208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527327374
118	NC_021898	TCG	2	6	7316	7321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527327375
119	NC_021898	TCC	2	6	7359	7364	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527327375
120	NC_021898	GTT	2	6	7467	7472	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527327375
121	NC_021898	AC	3	6	7649	7654	50 %	0 %	0 %	50 %	527327375
122	NC_021898	T	6	6	7685	7690	0 %	100 %	0 %	0 %	527327375
123	NC_021898	TGGTA	2	10	7692	7701	20 %	40 %	40 %	0 %	527327375
124	NC_021898	AAGC	2	8	7822	7829	50 %	0 %	25 %	25 %	527327375
125	NC_021898	TTA	2	6	7837	7842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527327375
126	NC_021898	A	6	6	7969	7974	100 %	0 %	0 %	0 %	527327375
127	NC_021898	T	6	6	8054	8059	0 %	100 %	0 %	0 %	527327375
128	NC_021898	TTC	2	6	8160	8165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527327375
129	NC_021898	ATTG	2	8	8220	8227	25 %	50 %	25 %	0 %	527327376
130	NC_021898	GAA	2	6	8304	8309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527327376
131	NC_021898	AG	3	6	8392	8397	50 %	0 %	50 %	0 %	527327376
132	NC_021898	ACC	2	6	8432	8437	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	527327376
133	NC_021898	CTT	2	6	8485	8490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527327376
134	NC_021898	CT	4	8	8511	8518	0 %	50 %	0 %	50 %	527327376
135	NC_021898	GAG	2	6	8565	8570	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527327376
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